《某科学的超电磁炮SOVA》围绕学园都市展开，这里聚集着拥有各种超能力的学生。主角御坂美琴是学园都市仅有的七名超能力者中排名第三位，能力为“超电磁炮”，被称为“电击公主”。她性格直爽、正义感爆棚。在学园都市里，御坂美琴和好友白井黑子、初春饰利、佐天泪子等人一起经历了诸多事件。她们会遭遇妄图利用超能力犯罪的邪恶组织，也会在日常生活中解决各种麻烦。比如在一些事件中，美琴会利用自己强大的电磁能力对抗敌人，保护身边的人。学园都市看似平静，实则暗流涌动，美琴等人不断在各种挑战中成长，在守护学园都市的同时，也收获了珍贵的友情。