《蜂蜜与四叶草2》延续了第一部的青春与温情，继续围绕竹本、真山、森田三位美术大学学生和他们身边的女孩们展开故事。竹本依旧默默喜欢着学姐阿久，在经历了第一部的懵懂后，他在这份感情里更加纠结，一方面难以抑制内心的爱意，一方面又因阿久的若即若离而痛苦。真山和理花的感情有了新的变化，理花在经历了生活的波折后，与真山的关系更加复杂。森田依旧是那个玩世不恭却又才华横溢的人，他的行为常常出人意料，但内心却有着对艺术的执着和对朋友的关怀。阿久在艺术创作的道路上不断探索，她的才华逐渐得到认可，但内心的孤独也愈发明显。在这个充满梦想与迷茫的校园里，他们共同经历着成长的酸甜苦辣，友情、爱情在岁月中交织，如同蜂蜜般甜蜜，又似四叶草般珍贵。