《超神学院第三季：神与神》延续前作世界观，故事围绕着超神学院的学员们和诸神展开。天使文明的凯莎女王，作为正义秩序的守护者，带领天使军团维护宇宙和平。然而，邪恶势力并未消停，莫甘娜，凯莎的妹妹，企图打破现有的秩序，她与恶魔文明勾结，不断制造事端。 在地球上，超神学院的学员们逐渐成长。葛小伦拥有了强大的银河之力，赵信、刘闯等也在战斗中不断提升实力。他们一边要应对恶魔的入侵，一边还要在复杂的局势中寻找自身的定位。 剧中，神与神之间的矛盾冲突不断升级。凯莎与莫甘娜这对姐妹的立场对立，引发了一系列激烈的战斗。超神学院的学员们也被卷入这场神与神的纷争中，他们在战火中历经磨难，为了守护地球和正义而战，在一次次艰难的战斗中，展现出坚韧不拔的意志和成长的蜕变。