《仙医神厨3》延续前作精彩，主角依旧凭借着仙医与神厨的双重身份在世间闯荡。在这一部中，他遭遇了更为强大的对手。有邪恶势力妄图抢夺他的神奇医术和厨艺秘籍，以此来达到不可告人的目的。主角一边要躲避邪恶势力的追杀，一边还要利用自己的能力救助更多的人。他在各地开起了饭馆，以美食济世，同时也在暗中调查邪恶势力的阴谋。在这个过程中，他结识了新的伙伴，他们一起并肩作战，经历了无数惊险刺激的冒险，最终成功挫败了邪恶势力的阴谋，守护住了自己的秘密和世间的正义。