《末代御医国语》以清末为背景，聚焦御医这一群体。杜仲（郭晋安 饰）本是乡下郎中，机缘巧合之下进入太医院成为御医。在太医院中，他遭遇了各种复杂的人际关系和权力斗争。同行之间为了利益和地位明争暗斗，杜仲既要应对这些内部纷争，又要医治皇室成员的疑难杂症。他凭借着精湛的医术和善良的品性，逐渐在太医院站稳脚跟。杜仲与光绪皇帝（黄浩然 饰）结下了深厚的情谊，一心想要帮助光绪推行新政。然而，宫廷局势变幻莫测，慈禧太后（罗兰 饰）手握大权，新政面临重重阻碍。杜仲在宫廷中历经风雨，见证了清王朝的衰败，他在坚守医者仁心的同时，也在乱世中努力寻找自己的立足之地。