《20 世纪少年最终章》延续前作剧情，以贤知、阿铁等人为代表的正义一方与妄图统治世界的“朋友”展开最终对决。“朋友”通过一系列阴谋诡计，控制人心、制造恐慌，企图构建他所谓的理想世界。贤知等人历经艰难险阻，在寻找真相的过程中不断成长。他们发现“朋友”的计划与儿时的幻想故事有着惊人的关联。在决战时刻，贤知等人凭借勇气、智慧和友情，冲破重重阻碍，直面“朋友”。最终，正义战胜邪恶，世界恢复了往日的和平，他们也守护住了曾经的梦想与希望。