《变种DNA 2》承接前作，故事发生在纽约的下水道。昆虫学家苏珊曾为对抗致命病毒创造出蟑螂人，虽成功消灭病毒，但蟑螂人也在下水道繁衍。此次，一群青少年闯入下水道探险，其中一人被变种蟑螂人抓走。学校老师克莱儿和学生的哥哥杰克为寻找失踪学生，也进入下水道。他们在黑暗潮湿的环境中，不断遭遇变种蟑螂人的袭击。这些蟑螂人拥有强大的攻击力和适应能力，行动敏捷且狡猾。在探索过程中，克莱儿和杰克逐渐揭开蟑螂人的生存习性和弱点。最终，他们凭借智慧和勇气，与变种蟑螂人展开殊死搏斗，成功解救出被困学生，也暂时消除了下水道中的威胁。