《人类灭亡报告书》由六个独立故事组成，每个故事都从不同角度探讨人类灭亡的可能。在《最后的人类》中，世界只剩最后一个男人，他却在此时收到女性的求救信号，当他找到对方后，奇妙的故事就此展开；《生日快乐》里，一个男人在生日当天遭遇各种离奇事件，世界逐渐变得荒诞，人类的生存面临未知威胁；《小苹果》讲述了外星生物降临地球，它们以一种诡异的方式与人类互动，人类文明在其影响下摇摇欲坠；《美丽新世界》中，虚拟世界看似美好，却隐藏着让人类走向灭亡的危机；《生命的代价》涉及克隆技术引发的伦理灾难；《人类灭亡报告书》则以纪录片形式展现人类灭亡前后的种种迹象。这些故事充满奇幻与惊悚元素，从多个维度展现人类可能面临的绝境。