在《蝙蝠侠超人大电影 - 最佳搭档》的故事里，超人在与佐德将军的战斗中，城市遭受严重破坏，无数人丧生。这让蝙蝠侠布鲁斯·韦恩对超人的存在产生质疑，认为他是个潜在威胁。而莱克斯·卢瑟则在暗中挑拨离间，利用人们对超人的恐惧和猜疑，加剧了蝙蝠侠与超人之间的矛盾。蝙蝠侠化身为黑暗骑士，决心向超人发起挑战。与此同时，莱克斯·卢瑟还策划了一个更大的阴谋，他制造出毁灭日这一恐怖怪物。在与毁灭日的惨烈战斗中，蝙蝠侠和超人逐渐意识到彼此的目标其实一致，都是为了保护人类。最终，两人摒弃前嫌，携手对抗毁灭日，尽管超人不幸牺牲，但他们的合作展现出了正义的力量。