《人狼1999》故事设定在一个充满危机与神秘的世界。故事发生在1999年，日本被联合国托管，东京被划分为特别行政区。在这片土地上，存在着一群特殊的人狼。公安九课的刑警川岛恭平，在执行任务过程中，逐渐揭开了人狼的秘密。他发现人狼并非单纯的怪物，背后有着复杂的政治阴谋和人性纠葛。随着调查深入，川岛陷入了一个巨大的谜团之中，他不仅要面对人狼带来的威胁，还要应对来自各方势力的压力。影片通过紧张刺激的情节，展现了人性在极端环境下的挣扎与抉择，以及政治阴谋背后的黑暗真相。