《超能萌女友》围绕着拥有超能力的萌妹子和普通青年男主展开。男主原本过着平凡的生活，一次偶然机会救下了失忆的女主。女主醒来后，展现出各种令人惊叹的超能力，比如瞬间移动、透视眼等。男主为了帮女主找回记忆，两人开启了一段奇妙旅程。在相处过程中，他们遭遇了一系列麻烦。有邪恶组织盯上女主的超能力，企图将她抓走进行研究。男主和女主相互扶持，一次次巧妙地摆脱邪恶组织的追捕。同时，两人感情也在患难中逐渐升温，最终不仅成功让女主恢复记忆，还一起打败邪恶组织，守护住了彼此的爱情和生活的安宁。