《天才眼镜狗》的主角是一只名叫皮博迪的天才狗狗，它不仅拥有博士学位，还发明了时间机器。皮博迪收养了人类小男孩舍曼，为了让舍曼更好地融入人类社会，送他去了学校。然而，舍曼在学校因说出皮博迪是自己的爸爸而遭到同学佩妮的嘲笑，冲动之下他用时间机器带佩妮穿越到了古埃及。在那里，他们引发了一系列混乱，还意外改变了历史。皮博迪不得不穿越时空去拯救他们，之后又带着两个孩子经历了特洛伊战争、文艺复兴等不同时代的冒险。在一次次的危机和欢乐中，舍曼学会了理解与包容，也更加珍惜和皮博迪之间的父子情。