《神奇动物：邓布利多之谜》延续了系列故事，故事背景依旧是魔法世界。阿不思·邓布利多知晓强大的黑巫师盖勒特·格林德沃正企图夺取魔法世界的控制权，而自己因过去的情感羁绊无法直接出手对抗他。于是，邓布利多委托纽特·斯卡曼德带领一支勇敢的团队，去执行阻止格林德沃阴谋的危险任务。团队成员们在旅途中遭遇了各种神奇又危险的魔法生物，他们不仅要应对这些生物的威胁，还要躲避格林德沃及其追随者的追杀。在一系列冒险中，众人逐渐揭开了邓布利多与格林德沃之间那段复杂而深刻的过往，也明白了这场战斗的意义远不止于权力争夺，更关乎魔法世界的未来走向。最终，团队能否成功阻止格林德沃，魔法世界又将何去何从，都在这场充满奇幻与惊险的冒险中一一揭晓。