《境界的彼方 剧场版 未来篇》延续了TV版的故事，主角神原秋人依旧拥有特殊体质，栗山未来则是身负使命的异界士。故事中，未来因之前与秋人的经历，内心充满矛盾与痛苦。她认为自己会给秋人带来危险，决定与秋人保持距离。然而，新的危机出现，强大的妖梦频繁现身，给世界带来威胁。秋人不愿放弃未来，努力靠近她，试图解开她的心结。在一次次与妖梦的战斗中，秋人与未来的感情不断升华，未来也逐渐放下内心的包袱。最终，他们携手对抗最强大的敌人，在激烈的战斗中，两人坚定地站在一起，共同守护着彼此和世界。