《钢之炼金术师：香巴拉的征服者》承接电视版剧情，爱德华·艾尔利克为了救回弟弟阿尔冯斯，付出了惨重代价，用自己的右臂换回弟弟的灵魂并将其固定在铠甲上，又失去左腿前往门的另一边寻找真理。在门的另一边德国，爱德华以机械铠装手臂和义肢的形象生活。他结识了克拉拉等朋友，还发现自己身处的世界存在与炼金术类似的科学力量。爱德华察觉到这个世界与自己原本世界有着神秘联系，且有人妄图利用这种联系达成不可告人的目的。为了回到原来的世界，拯救弟弟和修复被破坏的平衡，爱德华与敌人展开了激烈战斗。最终，他凭借坚定意志和智慧，在付出巨大牺牲后成功回到原来的世界，与弟弟团聚。