《海盗2：鬼怪的旗帜》承接前作故事，以大海为舞台展开新的冒险。前作中曾偷走玉玺的张思莱，这次与海盗们为了寻找消失的王室宝物再度出海。他们在航行途中遭遇了神秘的幽灵船，船上的鬼怪们似乎守护着巨大的秘密。朝鲜时代的海盗头目德裴，也加入到这场寻宝之旅中。各方势力在海上展开激烈交锋，不仅要面对彼此的争斗，还要应对幽灵船带来的恐怖威胁。在惊险刺激的冒险过程中，海盗们凭借着智慧和勇气，一次次化险为夷，逐渐揭开了宝物背后隐藏的真相。