在17世纪的日本，基督教传教活动被严厉禁止。葡萄牙传教士罗德里格兹听闻昔日恩师费雷拉在传教时变节，内心充满疑惑与痛苦。为了探寻真相并继续传教，他毅然踏上前往日本的危险之旅。 抵达日本后，罗德里格兹亲眼目睹了信徒们遭受的残酷迫害。他在地下教会的帮助下秘密传教，但很快被幕府察觉并追捕。在困境中，他不断挣扎，坚守着自己的信仰。 当他最终见到已变节的费雷拉时，内心受到巨大冲击。费雷拉劝说他放弃信仰，以避免更多信徒受苦。在经历了无数的折磨和内心的煎熬后，罗德里格兹最终做出了艰难的选择。这部电影深刻探讨了信仰在极端环境下的考验与挣扎。