《秦时明月之夜尽天明》承接上部剧情，故事围绕天明、少羽、石兰等少年的成长展开。天明在墨家机关城习得非攻，却也引来了阴阳家的觊觎。阴阳家高手如云，月神神秘莫测，她抓走了端木蓉，让天明等人陷入困境。少羽在战斗中逐渐展现出过人的武艺和领袖气质，与天明相互扶持。石兰身份成谜，她似乎隐藏着巨大的秘密，在与众人的相处中，也慢慢打开心扉。机关城被攻破后，众人踏上逃亡之路，一路上危机四伏，他们不仅要躲避秦军的追捕，还要应对阴阳家的阴谋。在这个过程中，天明不断成长，逐渐领悟墨家兼爱非攻的真谛，少羽也在磨砺中变得更加坚毅。他们与盖聂、高渐离等江湖高手并肩作战，共同对抗黑暗势力，为了正义和自由而战。