在宇宙中，赛尔号飞船上的赛尔机器人和精灵们继续着守护宇宙和平的使命。这一次，战神联盟成员之一的盖亚，被上古魔神咤克斯用计陷害，导致战神联盟分崩离析。盖亚被误解，只能独自踏上寻找真相、洗刷冤屈之路。在这个过程中，他结识了新的伙伴，一只充满正义感的小麒麟。小麒麟一心想要成为像盖亚一样强大的战士，于是与盖亚结伴同行。与此同时，咤克斯的阴谋逐渐展开，他妄图借助邪恶力量统治宇宙。盖亚和小麒麟在重重困难中不断成长，最终他们重新召集战神联盟，共同对抗咤克斯。经过一场惊心动魄的大战，他们凭借勇气、智慧和团结，战胜了咤克斯，拯救了宇宙，战神联盟也再次恢复往日的荣耀。