《圣剑使的禁咒咏唱》故事围绕着拥有特殊能力的少年天羽奏展开。奏是一名失去记忆的少年，他被转校到了培养“圣剑使”的私立狮子王机关学园。学园里的学生们都拥有使用“圣遗物”战斗的能力，这些圣遗物能发挥出强大的力量。 在学园中，奏结识了性格各异的伙伴，如傲娇少女火乃森剑臣、温柔善良的莉瑟莉丝等。然而，奏身上隐藏着巨大的秘密，他拥有被称为“禁咒咏唱”的强大力量，这股力量一旦失控就会带来巨大灾难。随着故事发展，学园不断遭遇各种危机，有来自外部邪恶组织的威胁，也有学园内部的权力斗争。奏和伙伴们一次次并肩作战，在战斗中逐渐揭开自己身世的谜团，同时也加深了彼此之间的羁绊，共同守护学园和世界的和平。