《我家的女仆太烦人了！》围绕着高中生佐藤一郎和女仆五十岚葵展开。葵原本是杀手组织培养的精英杀手，因组织解散，来到佐藤家当女仆。葵虽然有着高超的杀人技巧，但在日常生活中却状况百出，她总是以杀手思维处理日常事务，闹出不少笑话。比如她会用暗杀手段对付来家里捣乱的小混混，把家里弄得一团糟。佐藤一郎则在努力适应葵这个奇怪女仆的同时，还要应对学校生活和各种突发状况。两人在相处过程中，逐渐建立起了特殊的羁绊，故事在搞笑与温情中不断推进，展现出一段别样的主仆生活。