《新少林寺》以民国时期为背景，军阀混战，民不聊生。侯杰本是纵横一方的军阀，为人凶狠残暴，草菅人命。在一场阴谋中，他的家庭支离破碎，爱妻身亡，女儿下落不明，自己也身负重伤。走投无路的侯杰逃至少林寺，被僧人们收留。在少林寺中，侯杰经历了身体与心灵的双重洗礼，逐渐放下心中的仇恨与戾气，开始潜心修行。与此同时，曹蛮继续为非作歹，企图称霸一方。少林寺也因收留侯杰而陷入危机。最终，侯杰与少林寺的僧人们联手，与曹蛮展开了一场惊心动魄的决战。在这场战斗中，侯杰完成了自我救赎，用正义战胜了邪恶，而少林寺也在这场浩劫中坚守住了慈悲与正义的精神。