《生化危机4：战神再生》故事承接前作，爱丽丝在经历重重危机后，发现自己的超能力被保护伞公司剥夺。她来到了荒废的洛杉矶，这里丧尸横行，一片死寂。在城市中，爱丽丝遇到了克莱尔等幸存者，他们一同寻找安全的避难所。与此同时，保护伞公司为了消灭所有幸存者，派出了大量的丧尸和怪物。爱丽丝等人在逃亡过程中，遭遇了各种危险，如巨型水蛭、飞行怪物等。他们还发现了保护伞公司的阴谋，原来公司计划将所有幸存者引诱到一艘名为“阿拉斯加号”的游轮上，然后将其摧毁。最终，爱丽丝等人登上了游轮，与保护伞公司的军队展开了一场惊心动魄的决战。在战斗中，爱丽丝恢复了超能力，带领众人成功击败了敌人，摧毁了游轮，也给了保护伞公司沉重一击。