《亚马逊萌猴奇遇记》聚焦于亚马逊雨林中一群可爱的绒毛猴。故事从一只小绒毛猴的视角展开，它原本生活在温馨的猴群里，与家人朋友快乐地在雨林中穿梭、觅食。然而，一场突如其来的暴风雨摧毁了它们的家园，小绒毛猴与家人失散。在独自求生的过程中，它结识了不同的动物朋友，有善良的树蛙、聪明的鹦鹉。它跟着树蛙学会了寻找安全的藏身之处，和鹦鹉一起探索雨林中的食物来源。在这个过程中，小绒毛猴也遭遇了不少危险，如蟒蛇的追捕、老鹰的袭击。但它凭借着顽强的意志和不断学习到的生存技能一次次化险为夷。最终，历经千辛万苦，小绒毛猴在机缘巧合下重新回到了猴群，继续在亚马逊雨林中开启新的生活。