《肥佬教授2》中，哈金斯教授与美丽的卡拉步入婚姻殿堂，还迎来了可爱的三胞胎。然而，他体内的胖子韦恩因不满被冷落而分裂出五个不同性格的小人。这五个小人分别是娘娘腔的韦恩、烟鬼韦恩、赌鬼韦恩、暴徒韦恩和婴儿韦恩，他们的出现让哈金斯的生活陷入混乱。为了摆脱这些麻烦，哈金斯和助手们想出将韦恩的性格提取出来注入克隆体的办法。但克隆体韦恩却有着自己的打算，他企图抢走卡拉并破坏哈金斯的生活。一场围绕家庭与自我的闹剧就此展开。