《好人寥寥》围绕着一起军事案件展开。海军陆战队士兵圣地亚哥死亡，海军律师丹尼尔·卡菲和山姆·温伯格被指派为涉嫌谋杀圣地亚哥的两名士兵辩护。这两名士兵肯特·道森和托德·惠特克声称他们只是执行了所谓的“红色代码”命令。随着调查深入，卡菲发现案件背后涉及到基地指挥官内森·杰塞普上校。上校为了维护基地纪律和所谓的荣誉，似乎下达了不当指令。在法庭上，卡菲与杰塞普上校展开了激烈交锋，最终真相逐渐浮出水面，揭示了军队内部复杂的权力斗争、荣誉观念与人性之间的冲突。