《玛戈王后》以法国宗教战争为背景，故事围绕着玛戈王后展开。玛戈是法国国王查理九世的妹妹，她美丽聪慧却无奈成为政治的牺牲品。为了缓和天主教与新教的矛盾，她被迫嫁给新教领袖纳瓦尔国王亨利。然而，婚礼当晚就爆发了圣巴托罗缪大屠杀，天主教徒对新教徒展开血腥屠杀。玛戈暗中保护着亨利，两人在相处中产生了别样的感情。但宫廷中的阴谋与争斗从未停止，玛戈的母亲凯瑟琳王太后为了权力不择手段，不断挑拨各方关系。亨利在困境中努力求生，试图摆脱被控制的命运。玛戈则在爱情与家族、政治之间艰难抉择，她凭借着自己的智慧和勇气在复杂的宫廷斗争中周旋，书写着属于自己的传奇。