《异形4》的故事发生在遥远的未来，人类克隆出了蕾普莉，因为她体内有着异形的基因。克隆蕾普莉拥有了部分异形的特性，比如超强的力量和敏锐的感官。此时，一群科学家在太空船“贝蒂号”上进行异形的研究和培育。然而，异形逃出了牢笼，开始在船上大肆杀戮。蕾普莉与船员们为了生存，不得不与异形展开殊死搏斗。在战斗过程中，蕾普莉逐渐发现自己与异形之间有着一种特殊的联系。最终，蕾普莉和船员们决定炸掉飞船，与异形同归于尽。但蕾普莉在关键时刻发现自己孕育了一只异形皇后，她毅然选择与皇后同归于尽，让人类获得了暂时的安宁。