《潜伏3》故事围绕着少女奎恩展开。奎恩的母亲早逝，她能与鬼魂交流，这一能力让她备受困扰。一天，她被一个恶鬼纠缠，生活陷入恐惧之中。无奈之下，奎恩找到了灵媒伊莉丝寻求帮助。伊莉丝起初因之前的灵异事件心有余悸而拒绝，但最终还是决定出手。在调查过程中，他们发现恶鬼是因生前心愿未了而徘徊人间。伊莉丝和助手们深入灵异世界，与恶鬼斗智斗勇。然而，伊莉丝在一次行动中遭遇危险，生命受到威胁。最终，众人凭借勇气和智慧，帮助恶鬼完成心愿，让它得以安息，奎恩也摆脱了恶鬼的纠缠，回归正常生活。