《妖魂》围绕着天蚕教展开。天蚕教教主天蚕老人作恶多端，被大侠司马纵横打败后，其女聂小凤为父报仇，苦练天蚕功。聂小凤与书生吕腾空相恋，还生下了两个女儿，大女儿聂媚娘，小女儿聂桑青。然而，吕腾空发现聂小凤的天蚕教身份后，毅然离去。聂小凤由爱生恨，性情大变，继续为祸江湖。 司马纵横之子司马不平为了阻止天蚕教恶行，踏上江湖。他与聂媚娘相遇，两人情愫暗生。但聂媚娘身为天蚕教的人，立场与司马不平相悖。后来，司马不平与聂桑青也结识，三人陷入复杂的情感纠葛与正邪对抗中。最终，司马不平联合正义之士，与天蚕教展开决战，破除了天蚕教的阴谋，还江湖一片安宁。