《最好的我们 2016》围绕着平凡女孩耿耿和学霸余淮展开。中考时，耿耿因意外获得加分进入振华高中，在开学分班时，她与余淮相遇，两人名字连在一起像“耿耿于怀”，奇妙的缘分就此开始。在振华高中，他们结识了简单、贝塔等好友，一起度过了充满欢笑与泪水的高中时光。耿耿成绩普通，在学习上常遇到困难，余淮则热心地帮助她。他们一起经历了考试的压力、同学间的小矛盾，也有过青春的懵懂情愫。高考前夕，余淮家庭变故，成绩下滑，他选择逃避耿耿。多年后，耿耿回到振华，在曾经的教室回忆起过往，而此时余淮也再次出现在她的生活中，两人能否重拾当年的感情，续写青春的美好，令人期待。