《野良神》围绕着性格大大咧咧的少女壹岐日和与自称神明的夜斗展开。日和在一次意外中灵魂出窍，邂逅了落魄的夜斗。夜斗虽自称为神，却连一间神社都没有，靠帮人实现各种小愿望赚取五日元的报酬为生。日和为了恢复正常，请求夜斗帮忙，从此与他和他的神器雪音卷入了各种奇妙事件。雪音本是流浪少年，被夜斗收为神器，但他内心渴望被爱与认可，在成长过程中一度迷失自我，引发了不少危机。随着故事推进，夜斗的过去逐渐揭开，他那不为人知的痛苦经历和复杂身世浮出水面，而日和、夜斗与雪音之间的羁绊也在一次次冒险中不断加深。