《使徒行者国语》围绕着卧底展开故事。刑事情报科总督察卓凯手下有五名卧底，他们潜伏在黑帮不同势力中收集情报。然而，一份卧底人员的信息神秘泄露，五名卧底生命受到威胁，其中一名卧底牺牲。卓凯决心找出幕后黑手，揪出警队中的内奸。 在追查过程中，他结识了古惑仔薛家强。薛家强表面是黑帮成员，实则也是一名卧底，他与卓凯联手，一边应对黑帮的争斗，一边寻找真相。与此同时，刑事情报科高级督察叶兆良对卓凯产生怀疑，双方产生了不少冲突。 剧中还有警花丁小嘉，她也是卧底之一，性格古灵精怪。她在执行任务时与薛家强产生了感情。各方势力相互交织，警匪之间的界限也逐渐模糊，他们在复杂的局势中不断周旋，为了正义和真相而战。