《时间飞船 三恶人的逆袭》延续了《时间飞船》系列的奇幻冒险风格。故事中，以妖妮大姐为首的三恶人再度卷土重来，他们驾驶着造型奇特的时间飞船，妄图通过穿越时间来实现自己的邪恶计划。他们在不同的历史时期捣乱，破坏正常的历史进程。而丹平、纯子、凯达三人组成的正义团队，驾驶着时间飞船紧追不舍。每到一个时间点，双方都会展开激烈的较量。三恶人诡计多端，不断设下陷阱，但正义一方凭借着智慧和勇气，一次次化解危机，阻止三恶人的阴谋得逞，在一场场精彩刺激的对决中守护着时间的正常秩序。