《少年间谍第一季》围绕少年亚历克斯展开。亚历克斯原本只是普通少年，叔叔的离奇死亡打破了他平静的生活。原来叔叔是一名特工，亚历克斯被军情六处招募。他被迫接受危险任务，前往达利尔庄园调查。在那里，他发现了反派赫洛德的邪恶计划——用电脑病毒控制全球电脑。亚历克斯凭借智慧和勇气，在危机四伏的环境中周旋，不仅躲过了敌人的追杀，还找到了关键证据。之后他又被派往北极，阻止赫洛德的阴谋。在北极冰原上，亚历克斯与敌人斗智斗勇，最终成功挫败了赫洛德的计划，拯救了世界。这一季展现了亚历克斯从普通少年成长为勇敢间谍的过程，充满惊险刺激的冒险情节。