《少林寺传奇藏经阁》以明朝为背景，围绕着主人公徐子豪展开。徐子豪本是将军府的公子，因遭奸人陷害，家破人亡后逃至少林寺。在寺中，他结识了方丈等一众僧人，开始了在藏经阁的修行生活。期间，他不仅要面对寺内的清规戒律和艰苦训练，还要应对外部朝廷奸臣的威胁。徐子豪凭借着自己的智慧和勇气，一次次化解危机。他与朱若琴、紫云等人有着复杂的情感纠葛，同时也和僧人们建立了深厚的情谊。在不断成长的过程中，他逐渐领悟了少林武学和佛法的真谛，最终协助朝廷铲除奸臣，恢复了正义，也实现了自我的救赎与成长。