《侵略！乌贼娘第一季》围绕着来自海底的乌贼娘展开。乌贼娘因人类污染海洋，决定上岸侵略人类。她来到海边餐厅“柠檬”，在这里开启了一系列搞笑故事。餐厅老板藤子收留了乌贼娘，让她在店里打工。乌贼娘在适应人类生活的过程中状况百出，她不理解人类的各种行为和文化，闹出不少笑话。比如她会用触手做奇怪的料理，还试图用自己的方式改变人类对海洋的态度。同时，她与餐厅里的其他角色，像小渚、千鹤等也产生了许多有趣互动。在这个过程中，乌贼娘逐渐对人类有了新的认识，侵略计划也在不知不觉中发生了改变。