《青囊传》围绕神木族少女叶云裳和医药世家公子木星尘展开。云裳身负神木族秘术，却因族内纷争流落民国乱世的上海。她偶然结识了木星尘，两人一同卷入了一系列离奇事件。在上海，神秘的瘟疫突然爆发，百姓苦不堪言。云裳凭借神木族的独特医术，与木星尘携手对抗瘟疫。然而，他们的行动触动了当地恶势力的利益，遭到了百般阻挠。与此同时，云裳的身世之谜逐渐浮出水面，原来她的存在牵扯到一个巨大的阴谋。在破解阴谋的过程中，云裳和木星尘感情升温，共同成长，最终不仅拯救了百姓，也揭开了背后的真相。