《萌学园之圣战再起》延续了萌学园系列的奇幻风格。故事围绕着萌学园里的学生展开，艾格妮丝被暗黑势力控制，成为了攻击萌学园的工具。萌骑士们肩负起守护学园的重任，乌克娜娜、艾瑞克、谜亚星、焰王和欧趴等萌骑士各展所长。在战斗中，他们不断突破自我，发挥出强大的魔法力量。同时，同学们之间的友情也在困难中得到了升华，大家相互支持、彼此信任。面对暗黑大帝的阴谋诡计，萌骑士们一次次化解危机，最终成功拯救了萌学园，让学园恢复了往日的和平与欢乐，展现出勇气、友情和正义的力量。