《禁忌咒纹》的故事围绕着高中生篠宫时雨展开。时雨拥有特殊能力，能看见被称为“咒纹”的东西，而拥有咒纹的人会获得强大力量，但也会被卷入残酷的战斗。他的青梅竹马春崎美空也被卷入其中，美空意外获得了咒纹之力。 在这个世界里，各方势力为了争夺咒纹的力量展开了激烈战斗。时雨为了保护美空，不得不与各种敌人周旋。他们遭遇了拥有不同咒纹能力的对手，有的能操控火焰，有的能瞬间移动。随着战斗的深入，时雨逐渐发现咒纹背后隐藏着一个巨大的阴谋，这个阴谋关乎人类的未来。时雨和美空在战斗中不断成长，他们不仅要面对外部敌人，还要应对内心的恐惧和挣扎，努力揭开咒纹的秘密，阻止阴谋的发生。