《东京卍复仇者》围绕主人公花垣武道展开。武道发现自己拥有穿越到 12 年前的能力，而契机是得知国中女友橘日向与其兄橘直人死于东京卍会引发的争斗。为拯救日向，武道一次次穿越回过去。在过去，他结识了东京卍会的众多成员，像充满领袖魅力的佐野万次郎、重情重义的场地圭介等。武道凭借未来的记忆，努力改变东京卍会的走向，阻止悲剧发生。他在一次次战斗与抉择中成长，既要应对敌对势力的挑战，又要处理内部成员的矛盾。随着故事推进，更多秘密和阴谋浮出水面，武道能否成功改写日向的命运，东京卍会又将何去何从，充满了悬念。