《超级小郎中2》延续第一部剧情，小郎中朱小天依旧凭借着高超的医术和善良勇敢的品质在江湖中闯荡。他与伙伴们一同卷入了新的江湖纷争，这次他们面对的是更为强大且神秘的对手。在寻找神秘医术秘籍的过程中，朱小天结识了更多志同道合的朋友，也遭遇了诸多心怀不轨之人的阻拦。他们在各个门派之间周旋，破解一个又一个谜题。朱小天不仅要应对外部敌人的挑战，还要处理伙伴之间偶尔产生的矛盾和分歧。在一系列惊险刺激的冒险中，朱小天不断成长，他的医术也得到了进一步提升，最终成功解开秘籍之谜，守护了江湖的和平与正义。