《天才萌宝复合计划》围绕着天才萌宝和他父母之间展开故事。萌宝的父母因一些误会而分开，家庭就此破碎。但聪明绝顶的萌宝不甘心家庭如此支离破碎，于是精心策划了一系列复合计划。萌宝利用自己的智慧，制造各种让父母相处的机会。比如故意在学校假装生病，让父母同时赶到学校。在相处过程中，父母之间曾经的感情逐渐被唤醒，那些误会也慢慢有了解开的迹象。然而，复合之路并非一帆风顺，他们之间还面临着来自外界的压力和新的矛盾。但萌宝始终没有放弃，不断地用自己的方式推动着父母关系的缓和，最终能否成功让父母重归于好，令人期待。