《我在现代养女帝》的故事充满奇幻色彩。主角意外收养了一个小女孩，而这个看似普通的小女孩实则大有来头，她竟是女帝转世。在现代社会的背景下，主角开始了养女帝的奇妙生活。小女孩保留着女帝的一些习性和思维，面对现代的种种新鲜事物，闹出不少笑话。随着相处，主角与小女孩建立了深厚的感情。然而，女帝的身份引来了一些神秘势力的觊觎，他们妄图利用女帝的力量达成自己的目的。主角为了保护小女孩，与这些势力展开了一系列斗智斗勇的对抗，在这个过程中，他们的关系更加紧密，也一同在现代社会中经历着成长与冒险。