《悬案密码3》聚焦于卡尔和搭档罗斯对一桩陈年旧案的调查。案件起始于1961年，四个女学生在一场大火中丧生，其中三人当场死亡，一人在医院不治。多年来，这起案件被认定为意外。然而，卡尔和罗斯在重新调查时发现诸多疑点。他们在调查过程中遭遇重重阻碍，有人试图掩盖真相。随着深入挖掘，他们发现这并非简单的意外，背后隐藏着一个惊人的秘密。原来，这与当时的社会黑暗面有关，涉及到一些权贵的丑恶行径。卡尔和罗斯凭借着执着和智慧，逐步揭开真相，让多年前的冤魂得以安息，也将那些隐藏在黑暗中的罪恶公之于众。