《生化危机：恶化》故事发生在浣熊市事件的十年后，此时安布雷拉公司已倒台，但生化危机的阴影仍未消散。美国中西部的一座城市发生了生化武器泄漏事件，丧尸开始在城市中肆虐。里昂·S·肯尼迪作为美国政府特工，被派往该城市调查真相并协助处理危机。与此同时，克莱尔·雷德菲尔德以民间救援组织成员的身份也来到这里，她希望能帮助受困的民众。在调查过程中，他们发现这起事件背后隐藏着一个巨大的阴谋，有人企图利用生化武器达到不可告人的目的。里昂和克莱尔在充满丧尸的城市中一边战斗求生，一边寻找幕后黑手，最终成功阻止了阴谋的进一步扩大，拯救了城市和民众。