《恶之华》围绕着少年春日高男展开。春日是个内心孤独且有些懦弱的学生，他在学校里平凡无奇，常沉浸在文学世界中。一次偶然的机会，他拿走了同学仲村佐和的体操服，这一冲动的行为让他陷入了惶恐与自责。而仲村佐和是个行为举止怪异、游离于班级群体之外的女孩，她发现春日拿走体操服后，以此为契机接近春日。两人的关系逐渐变得微妙，春日在与仲村的相处中，内心的黑暗面与对美好事物的向往不断碰撞。在这个过程中，春日经历了自我认知的挣扎与成长，他开始面对自己内心深处的“恶”，也在与仲村的纠葛中，逐渐理解了人性的复杂和情感的真谛。