小智、小遥、小胜和小刚来到了绿茵镇，这里正举办着一年一度的流星嘉年华。传说每过一千年，基拉祈就会从长眠中苏醒，在流星嘉年华时实现人们的愿望。小智一行人遇到了少年东史郎，他拥有能让基拉祈苏醒的笛子。然而，邪恶的古鲁夏盯上了基拉祈，想利用它实现自己统治世界的野心。古鲁夏抓走了基拉祈，小智等人挺身而出展开营救。在战斗中，基拉祈发挥出强大力量，小智他们也全力协助。最终，他们成功击败古鲁夏，解救了基拉祈。基拉祈实现了东史郎的愿望后，再次陷入沉睡，而小智一行则带着这段奇妙经历继续踏上旅程。