《愤怒的菩萨》以台湾黑道为背景展开故事。主角陈莫是一名黑帮分子，在一次黑帮冲突后，他带着抢来的钱和受伤的兄弟阿泰逃亡。在逃亡途中，他们来到了一个偏远的小镇。陈莫在小镇上遇到了善良的寡妇阿雪和她的孩子，逐渐被他们的温暖所感染，内心开始有了转变。然而，黑帮老大并没有放过他们，派人四处追杀。与此同时，警方也在对他们展开追捕。在重重压力下，陈莫一边要保护自己和兄弟，一边要面对内心的挣扎。最终，他在正义与罪恶之间做出了艰难的抉择，也让愤怒的菩萨有了平息怒火的可能，整个故事充满了人性的挣扎与救赎。