《恩爱两不疑》讲述了帝后萧锦昀和徐钰意外互换身体后发生的一系列趣事。原本相看两厌的两人，在互换身体后，开始理解对方的处境。萧锦昀以徐钰的身份体验到后宫生活的复杂，徐钰以萧锦昀的身份处理朝堂事务。在这个过程中，他们发现彼此都有不为人知的一面。萧锦昀看到徐钰的聪慧果敢，徐钰也体会到萧锦昀治理国家的不易。两人在不断磨合中，感情逐渐升温，从互相嫌弃到相互理解、恩爱有加，最终携手共同守护家国，谱写了一段甜蜜又动人的爱情故事。